Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC5O15511 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARPC5O15511 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms