Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms