Protein–RNA interactions for Protein: O14656

TOR1A, Torsin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1AO14656 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOR1AO14656 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOR1AO14656 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms