Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS6O14544 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms