Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms