Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KRW8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KRW8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KRW8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KRW8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KRW8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KRW8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KRW8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KRW8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KRW8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KRW8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KRW8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KRW8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KRW8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KRW8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KRW8 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KRW8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KRW8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KRW8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
J3KRW8 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
J3KRW8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
J3KRW8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
J3KRW8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
J3KRW8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
J3KRW8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
J3KRW8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
J3KRW8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
J3KRW8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
J3KRW8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KRW8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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