Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms