Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms