Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms