Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms