Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms