Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23AA6NH52 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms