Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC182A6NF36 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC182A6NF36 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms