Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms