Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms