Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN6Q9Y6Q1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN6Q9Y6Q1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN6Q9Y6Q1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN6Q9Y6Q1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN6Q9Y6Q1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN6Q9Y6Q1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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