Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms