Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms