Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM2AQ9Y2K7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM2AQ9Y2K7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM2AQ9Y2K7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM2AQ9Y2K7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM2AQ9Y2K7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM2AQ9Y2K7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM2AQ9Y2K7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM2AQ9Y2K7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM2AQ9Y2K7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM2AQ9Y2K7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM2AQ9Y2K7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM2AQ9Y2K7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM2AQ9Y2K7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms