Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms