Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms