Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
CEP164Q9UPV0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CEP164Q9UPV0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CEP164Q9UPV0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms