Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZMYND8Q9ULU4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZMYND8Q9ULU4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms