Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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