Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms