Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC24A2Q9UI40 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC24A2Q9UI40 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms