Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms