Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms