Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms