Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms