Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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