Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms