Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms