Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms