Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AL117339.1-201ENST00000419779 428 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms