Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRDM8Q9NQV8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM8Q9NQV8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms