Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
IL1RAPQ9NPH3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL1RAPQ9NPH3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms