Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms