Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRA1Q9HD15 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms