Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms