Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2M9

RAB3GAP2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP2Q9H2M9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP2Q9H2M9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3GAP2Q9H2M9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms