Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms