Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms