Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ROPN1BQ9BZX4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms