Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5DQ9BY66 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms