Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARD11Q9BXL7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms