Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms