Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS5

TRMT61B, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61BQ9BVS5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRMT61BQ9BVS5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRMT61BQ9BVS5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms