Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms