Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF4Q9BUZ4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms